Мне это понадобилось потому что моя девзона работает внутри виртуальной машины, в которой время регулярно теряется и переставляется. Хотя бы просто потому, что виртуалка выключается за ненадобностью в нерабочее время. В общем синхронизироваться совсем просто на самом деле:

# Проверяем текущую таймзону
more /etc/timezone

# Если надо конфигурируем правильную? ту которая нам нужна
sudo dpkg-reconfigure tzdata

# Ставим собственно сам модуль
sudo aptitude install ntpdate

# Обновляем локальное время с удаленного ntp-сервера (ntp-сервера можно поглядеть в Gooogle)
sudo ntpdate 0.ru.pool.ntp.org